现代日本人的直系祖先很可能是在新石器时代进入日本的。这时连接日本与大陆的路桥已经沉没，原始人只有三条路可以进入日本：1、横渡韩半岛与日本之间的狭窄海峡；2、沿太平洋第一岛链，从库页岛方向进入北海道；3、从东南亚出发经关岛、琉球群岛、钓鱼岛进入日本南部。这种看法与体质人类学的看法不谋而合。经第一条路线，通古斯人进入日本；经第二条路线，白种的古高加索人进入日本，这就是北海道的阿伊努人；经第三条路线，马来人进入日本。从语言学上也能找到一些证据：日语与韩语一样都属于阿尔泰语系，尽管日语号称世界上最难学的语言之一，但对韩国人来说它并不难学。最让人迷惑不解的是日本古坟里的壁画，画面上，墓主人身穿合体的衍缝棉衣，穿着铠甲，有的还有文身；他们骑在马上，脚插在马蹬里。这是典型的游牧民族打扮！我们知道弥生人几乎没有马，不可能发展出这么完善的骑兵装备。我们还知道，韩民族和汉族都是以步战为主的民族，也不可能把完善的骑兵装备传到日本。那么这种完善的游牧文明来自哪里呢？是匈奴人还是古通古斯人？我们无法考证。

日本是否单一民族？日本民族从何而来？在日本古代，向大和朝廷挑战的的原日本人，其真相又如何？熊袭、隼人、虾夷、土蜘蛛族、国栖族、出云族、肃慎，这些民族又是从何而来？日本海岸的独立国「越国」 在山形县的小国町，有一个古志王神社。 古志族是住在中国东北至黑龙江流域沿海州的通古族。在日本古代，他们民族迁徙南下，渡海至北海道治理日本一带。据说他们雕刻祖先石像，以祭拜祖先。现在古志王神社祭拜的神像，是镰仓时代一刀雕（留下小刀刻痕的雕法）的古志王像。古志国是日本飞鸟时代（七世纪初）的国名，又写成越国或高志，到大化革新时，名称统一成越国。越国的位置在今日新泻县至福井县北部。之後，从山形县、秋田县至青森县的最北端，都称为越国。到了七世纪後半的天武、持统天皇时期，越国三分为越前、越中、越後，此称呼直用到现在。在越後新泻的新发田市，也有个古志王神社。当地的民间信仰有这样的传说：只要在神社的门缝或裂缝涂上红土，再将红土涂在身体上的话，到了冬天，皮肤就不会冻裂。从此可见，古志王原本是寒地之神。在《日本书纪》神代的造国神话里，有一个越州的地名。

移居越国的通古族，其中心份子当是肃慎。他们本是中亚的游牧民族，後来势力从中国东北延伸至黑龙江流域及沿海州，再迁徙至北海道或日本东北地方的日本海岸。肃慎这名称，是隋唐时，称呼先秦时期居住於东北地方的民族的总称。日本的史料，也沿用此称呼。《日本书纪》记载阿倍比罗夫曾率水军北上，三次进行「讨虾夷」、「征肃慎」。在第三次征讨时，於渡岛和肃慎的船只遭遇。肃慎的船只以羽毛插在木头上当作旗帜。比罗夫试图与肃慎交易，於是在海岸堆积丝织品、兵器、铁器等物。结果肃慎方面来了两个老人，他们拿走丝织衣服与麻布。此外，也有很多从东北地方上京献马的记录。这些马是白色苇毛、白蹄的欧亚大陆产的名马。除了马匹之外，肃慎还产名叫「独犴」的北方野犬、箭筒、砂金等名产。迁徙至山形县的肃慎人，由於精通采矿、采金技术，逐渐往内陆深入，一度还曾到达茨城县的鹿岛。至今山形县内及鹿岛附近，仍流传着通古族的传说。

一进入八世纪，肃慎的子孙靺鞨族就开始抬头。靺鞨人原本是住在黑龙江流域，为求较温暖之地，於是进入松花江流域到辽宁东南部的高句丽境内。那些移居北海道，或日本东北地方的称为'肃慎'，而移居高句丽北部的则称为靺鞨。他们都是通古族。六六三年，唐朝与新罗的联军打败了日本与百济的联军，新罗统一了韩半岛。高句丽灭亡后不久高句丽遗将大祚荣带领原高句丽,靺鞨人在高句丽旧地上，建立了渤海国。渤海国於七二七年为和日本签订通商条约，派遣使者至日，和日本维持约二００年的正式外交关系。这二００年间，甚多的渤海靺鞨人涌到日本。单单在七四六年一年，就有一千一百多人登陆山形县，归化为日本人。因为山形县、新泻县一带，都是通古族的同胞，所以对他们而言，一定觉得非常有亲近感。据《续日本纪》记载，在越後（新泻县）有「狄」族或「虾狄」族登场。 狄族不仅活跃於越後，而且深入东北地方。这狄族究竟是什麽民族呢？七０九年，虾狄叛乱大和朝廷，所以大和朝廷在山形县设征狄所，藉以调派武器与船只。由於叛乱不断，大和朝廷一面派持节镇狄将军讨伐，一方面派使者到靺鞨的根据地，也就是东北的渤海国去交涉。狄族大概是高句丽被新罗灭亡时，流亡到越後的靺鞨族的一支。他们不断伸张势力，半世纪後，建立流亡国家，拒绝服从中央政权。